女朋友的爸爸与妈妈是同母异父的关系

根据你的情况属于近亲结婚的，下一代遗传病的几率较大。
根据你的情况属于近亲，应该禁止结婚的，以免影响下一代。如果怀孕宝宝发育畸形对家庭及社会都是一种负担。

你们这种情况属于五代以内的血亲，最好不结婚，如果结婚的话，孕育的下一代，得先天性遗传疾病的可能性要比普通人群高得多。