月经后两天同房,第二天内裤上有咖啡色分泌物

月经出血的结束时期，会有量较少，如果是在这个时期有阴茎插入性交，在性的刺激下，子宫充血，有可能还会有少许的异常分泌物排出，容易伴随有病菌的感染。
建议性生活的时间安排在月经干净3天后进行，这样可以减少感染的可能，你现在需要到妇科做检查，如果是有病菌的感染，需要根据检查后所知道的感染菌，选择甲硝唑或者是制霉菌素等药物进行治疗，同时外阴部用洁尔阴药物清洗。